Didyme est un ancien sanctuaire dédié à Apollon, les restes à moitié ruinés de son imposant temple ont gardé une partie de sa majesté.
Un oracle "exerçait" déjà à Didyme avant l'arrivée des Ioniens, le nom même de Didyme est d'origine anatolienne.
A l'arrivée des grecs au XIe siècle avant notre ère, le culte d'Apollon pris la place de l'ancien.
Des prêtres originaires de Delphes y officiaient. Tous les quatre ans il s'y tenaient les "Didymales", festival de théâtre, musique et compétitions athlétiques.
Aire sacrée, Didyme ne fut jamais une ville, bien qu'elle fut pour un temps sous la dépendance de la cité voisine de Miletus.
Un premier temple de taille deux fois plus petite que l'actuel édifice fut construit entre les VIIIe et VIe siècle avant J-C. 
Celui-ci fut détruit en -494 par les Perses qui vainquirent les insurgés grecs.
Avec le passage d'Alexandre le Grand, un nouveau temple fut entrepris, dont les vestiges nous sont parvenus.
La construction ne fut jamais terminée entièrement, probablement en raison des problèmes d'ingénierie liés à l'importance de la structure. Cinq siècles de travaux n'en verront pas l'achèvement.
En 385 de notre ère, l'édit de l'empereur Théodose contre les pratiques païennes mis un terme définit au projet.
L'édifice subit un tremblement de terre au moyen-âge qui mis à terre la plupart des colonnes. Aujourd'hui on peut voir des pierres du monument dans les murs de certaines maisons du village.
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